Update na verzi 8.50 je venku a s ním se do hry podle očekávání vrátil i Thanos. Herní mód inspirovaný Avengers je ovšem zcela nový.
Ve Fortnite: Endgame proti sobě bojují dvě armády, tedy hrdinové a záporáci. Každá strana má přitom svůj úkol a hráči se respawnují, dokud se někomu nepodaří misi splnit.
Záporáci hledají kameny nekončena. Hráč, který najde kámen jako první, se promění v Thanose. S dalšími nalezenými kameny pak stoupá jeho síla a zvyšuje se úroveň zdraví všech Chitauri. Záporáci vyhrají, když se Thanosovi podaří najít všech šest kamenů a posléze pozabíjet všechny hráče.
Hráči na straně hrdinů dostanou mapu pokladů, na které jsou vyznačené legendární zbraně Avengers. Jde o luk (Hawkeye), sekeru (Thor), štít (Kapitán America) a rukavice s raketomety (Iron Man). Úkolem hrdinů je porazit Thanose a jeho armádu Chitauri.
I v případě módu Endgame platí, že je ve hře pouze dočasně. Zatím ale není jasné dokdy konkrétně.
